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Diffusion des variantes du SARS-CoV2 sur le territoire français : ce qui change pour les tests et les conditions d’isolement

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Un DGS-URGENT envoyé le 7 février 2021 revient sur les stratégies de freinage de la propagation des variantes du SARS-CoV-2 et précise les nouvelles modalités de testing et d’isolement.

Ces recommandations concernent aussi bien les kinésithérapeutes réalisant des tests antigéniques et/ou RT-PCR que tous les professionnels de santé susceptibles d’être positifs ou au SARS-CoV-2.

TESTER – La stratégie de criblage des variantes d’intérêt est généralisée

Tout test virologique donnant lieu à un résultat positif doit désormais obligatoirement faire l’objet d’une RT-PCR de criblage en seconde intention, réalisée dans un délai de 36 heures maximum, afin de déterminer s’il s’agit d’une contamination par une variante d’intérêt.

Les laboratoires réalisant les tests de criblage doivent en transmettre les résultats aux laboratoires ayant réalisé le test de première intention, qui ont la responsabilité de signaler à la personne contaminée qu’il s’agit d’une contamination par une variante d’intérêt, et laquelle.

Par ailleurs, cette information sera ensuite confirmée par le traceur de l’Assurance maladie en charge du contact-tracing.

Dans le cadre de la stratégie de criblage actuelle, il est demandé de n’utiliser, en seconde intention, que les kits RT-PCR ayant deux cibles dont au moins la mutation N501Y, commune aux 3 variantes d’intérêt actuellement circulantes,et permettant de distinguer la variante 20I/501Y.V1 d’une part et les variantes 20H/501Y.V2 et 20J/501Y.V3 d’autre part.

La liste des kits RT-PCR de criblage pouvant désormais être utilisés est disponible sur le site du Ministère des Solidarités et de la Santé.

Des travaux sont en cours pour permettre l’utilisation et la généralisation de ces kits en première intention pour le diagnostic primaire. Par ailleurs, le ministère a pour objectif d’encourager le développement de kits ciblant de nouvelles variantes d’intérêt potentielles, et en premier lieu la mutation 484K, responsable du risque d’échappement immunitaire, qui seront déployés et généralisés dès qu’ils seront disponibles.

Le dispositif de recherche des variantes d’intérêt est étendu aux tests antigéniques rapides. Ceux-ci doivent conserver toute leur place dans la stratégie de lutte contre l’épidémie, selon les indications actuellement en vigueur. Les tests antigéniques avec un résultat positif doivent désormais faire l’objet d’un second prélèvement, en vue d’une RT-PCR de criblage, afin de rechercher les mutations spécifiques des variantes d’intérêt. Lorsque ce second prélèvement peut être réalisé dans le même temps, celui-ci doit être privilégié, dans le cadre d’un conventionnement entre acteurs.

Dans le cas contraire, le patient doit être adressé à un laboratoire de biologie médicale pour la réaliser ou bénéficier d’un prélèvement réalisé à domicile par un professionnel de santé.

La recommandation de renvoyer vers une RT-PCR les personnes de retour de voyage, ou en lien avec une personne ayant voyagé récemment, ou vivant dans une zone où une augmentation brusque de l’incidence est observée, se présentant pour la réalisation d’un test antigénique rapide, reste en vigueur.

Ce que cela change pour vous :

●       Si vous réalisez des tests RT-PCR, vous devrez prévenir votre patient que si son test est positif, il devra refaire un un test RT-PCR de criblage permettant de déterminer s’il est porteur d’un variant du SARS-CoV-2

●       Vous pouvez trouver quel test RT-PCR de criblage utiliser sur le site https://covid-19.sante.gouv.fr/

●       Si vous réalisez des tests antigéniques et RT-PCR, et si le test antigénique est positif, vous devez réaliser, dans la foulée du résultat,  un test RT-PCR de criblage. Si toutefois vous ne disposez pas d’un kit adapté, vous devez renvoyer votre patient vers un laboratoire de biologie qui pratique les tests RT-PCR de criblage ou lui proposer de faire venir un professionnel de santé à domicile pour assurer le prélèvement.

ALERTER –la recherche de chaînes de transmission supplémentaires autour des cas de variantes d’intérêt est renforcée

Les opérations de tracing et d’isolement continuent d’être déclenchées dès la réception du résultat du test, PCR ou TAG, de première intention sans attendre les résultats de la RT-PCR de criblage.

Les dispositions de renforcement lors d’une contamination par variante sont déclenchées lors de la réception du résultat de la RT-PCR de criblage, sans attendre une confirmation par un éventuel séquençage.

La priorité demeure l’isolement sans délai des cas et le déclenchement rapide de la recherche de cas contacts.

Il convient de sensibiliser le patient porteur d’une variante d’intérêt au risque de contagiosité accrue et à l’importance d’un respect particulièrement strict de l’isolement et des gestes barrière.

Pour rappel, dans le cadre du tracing de niveau 2 et des investigations de niveau 3 autour de ces cas, il sera également demandé à l’ensemble des contacts à risque identifiés autour des porteurs de variantes d’intérêt de prévenir eux-mêmes (contact-warning) les personnes avec qui elles ont été en contact à risque depuis leur dernière exposition à risque avec le cas index (contacts de seconde génération).

Pour celles-ci les recommandations suivantes seront proposées:

  • Renforcer l’application des mesures barrières et notamment le port du masque grand public filtration supérieure à 90% ou du masque chirurgical en présence d’autres personnes;
  • Télétravailler dès lors que cela est possible;
  • Réduire volontairement ses contacts sociaux durant les 7 jours suivant ;
  • Réaliser un test diagnostic sans délai au 1er symptôme. Les personnes contact reçoivent un SMS ou un mail les orientant sur le site de l’Assurance maladie qui leur est dédié (https://declare.ameli.fr/sms/) et qui intègre des consignes spécifiques.
  • Dispositions renforcées pour les variantes 20H/501Y.V2 et 20J/501Y.V3
    • Les contacts à risque des personnes porteuses d’une variante 20H/501Y.V2 ou 20J/501Y.V3 doivent bénéficier d’un test PCR, à J0 (dès son identification), afin de démarrer sans délai les opérations de contact-tracing s’il est positif.
    • En cas de résultat positif, le criblage par une RT-PCR de seconde intention est réalisé.
    • Une attention particulière devra être apportée, en cas de test négatif, à l’importance de bien respecter la période de quarantaine de 7 jours depuis le dernier contact à risque et sur la nécessité de réaliser un test RT-PCR à J7, à l’issue de cette période.

 

➔      Que vous soyez cas-contact direct ou cas index (contact de seconde génération), vous ne devez pas vous rendre à votre cabinet ni effectuer de visite à domicile.

➔      Vous devez vous isoler immédiatement.

➔      Si la personne qui vous a contaminé est porteuse du SARS-CoV-2 originel, vous devez attendre 7 jours avant de réaliser un test RT-PCR – sauf si vous avez des symptômes ou si vous vivez sous le même toit que la personne : auquel cas, vous devez faire un test immédiatement.

➔      Si la personne qui vous a contaminé est porteuse d’une variante 20H/501Y.V2 et 20J/501Y.V3 du SARS-CoV-2 : vous devez réaliser immédiatement un test RT-PCR.

PROTÉGER – Le suivi du respect de l’isolement des personnes porteuses d’une variante d’intérêt est intensifié

La mise en œuvre d’un isolement précoce et bien respecté pour les personnes porteuses d’une variante d’intérêt est une priorité.

Pour rappel, les personnes (cas confirmé et personnes contact à risque) suspectées d’avoir fait l’objet d’une contamination par une variante et les personnes dont la contamination par une variante a été confirmée font l’objet d’un suivi renforcé (isolement/quarantaine) :

  • Les visites à domicile réalisées par des infirmiers libéraux sont programmées et proposées systématiquement ;
  • Lors de la prise de contact par la CPAM, les personnes concernées dont la situation personnelle laisse présager un fort risque de propagation (personnes vivant en famille, notamment avec des proches à risque, etc.) se voient systématiquement proposer une offre spécifique d’hébergement via les cellules territoriales d’appui à l’isolement (CTAI)

Pour les variantes d’intérêt 20H/501Y.V2 et 20J/501Y.V3, la durée d’isolement est portée à 10 jours.

Du fait de la contagiosité accrue de ces deux variantes, un test de sortie d’isolement doit être systématiquement réalisé pour les personnes qui en sont porteuses.

Après 10 jours pour les contaminations par une variante d’intérêt 20H/501Y.V2 ou 20J/501Y.V3, et en l’absence de fièvre depuis plus de 48h pour les patients zéro symptomatiques, la levée de l’isolement est désormais conditionnée pour les cas confirmés à l’obtention d’un résultat de test négatif.

Si le test revient positif, l’isolement est prolongé de 7 jours après ce résultat. Dans les cas de contamination confirmée par une de ces deux variantes, une deuxième visite infirmière sera programmée, notamment pour réaliser le test prévu pour autoriser la sortie de l’isolement.

Dispositions relatives à l’Éducation nationale :

  • Pour les variantes d’intérêt 20H/501Y.V2 et 20J/501Y.V3, la fermeture de la classe est automatiquement prononcée, suite à une investigation de niveau 3 à la main de l’ARS, et l’ensemble des élèves -ainsi que le ou les professeurs testés et les cas contacts identifiés à J0 et J+7 par RT-PCR, si l’un des cas suivants est confirmé:
    • 1 enfant COVID+ contaminé par une des deux variantes d’intérêt;
    • 1 enfant cas-contact d’un parent ou membre de la fratrie contaminé par une des deux variantes d’intérêt.

 

➔      Si vous êtes testé positif à une des variantes 20H/501Y.V2 ou 20J/501Y.V3 du SARS-CoV-2, votre isolement initial devra durer 10 jours. La levée de cet isolement est conditionnée par un test négatif. Vous devrez rester isolé jusqu’à ce que le test soit négatif.